En el torneo 1999-2000 con Leonardo Mata como entrenador Barrio México llega hasta semifinales perdiendo la serie (3-4) contra el Municipal Osa que al final ganaría el torneo. El exjugador Alexis Alfaro fue el entrenador en segunda división en la década de los 80´s e inicio de los 90´s, disputando cuatro hexagonales seguidas de 1987 a 1990, pero sin alcanzar la final. Este hecho lleva al equipo rojiblanco a no lograr la victoria durante las primeras 10 jornadas de liga, sin embargo, Francisco Rodríguez es capaz de enderezar la situación y finalmente logra la permanencia más épica de la historia del club, equipacion atletico de madrid siendo calificada por algunos medios de comunicación como «salvación milagrosa».
